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只要是含有细胞核的细胞都能做DNA亲子鉴定，所以亲子鉴定可以采集的样本很多，可以分为常规样本和特殊样本。常规样本主要是指血痕、口腔拭子、毛发、烟蒂，特殊样本主要是指牙刷、指甲、嚼过的口香糖、精液、精斑、流产物、经血、骨骼等。以下是亲子鉴定常规样本的采集方法。
亲子鉴定样本：
血痕样本：用针轻刺皮肤表面(手指尖、耳垂、脚后跟以及身体表面任何部位)，待血流出时，用准备好的纱布轻轻擦拭，在其表面留下3个如同黄豆大小的血印即可。将其用白纸或则信封包好，不能用塑料袋装。注：采血的人半年之内没输过别人的血两年之内没进行过骨髓移植。
口腔拭子样本：拿起一根棉签伸进口腔在脸颊内侧的肌肉壁上来回刮，让棉头充分湿润，刮拭3-5下，同样方法取3-5根，将其用白纸或则信封包好，不能用塑料袋装。
毛发样本：拔下3-5根带有白色毛囊的毛发，阴干，用A4纸包好放入信封，不能用塑料袋装。
烟蒂样本：清洁双手，不要直接用手触摸烟头，尽量使用干净的镊子或卫生纸装到干净的信封,取3-5个烟头，不能用塑料袋装。
